在兄长蒙哥做蒙古大汗初期，忽必烈就以皇太弟的身份辅佐兄长，从此开始接触政治方面的事宜。每当在商讨奏折的时候，忽必烈就会为他的汗兄出谋划策，对于弟弟忽必烈的上奏，蒙哥一般都是言听计从。虽然很多忽必烈的建议都是出自金莲川府藩邸谋臣之手，但是蒙哥对忽必烈却是越来越信赖，不久忽必烈就受命掌管在赤老温山的所有军民。
蒙哥的这一授命明确了忽必烈的管辖范围，使得忽必烈总领漠南以来第一次有了自己的管辖区域。蒙哥大汗这样安排，就是为了让他的弟弟忽必烈替他掌管漠南的军政大权，对于这样的安排，蒙哥大汗觉得是很有必要的。忽必烈接到诏书之后跟王府的官员幕僚们都大摆筵席庆祝，大家都非常兴奋，只有王府文臣姚枢感觉像是有心事的样子。忽必烈当然也看出了端倪，宴会过后，他跟姚枢进行交谈，姚枢认为这一授命很可能会造成忽必烈与兄长之间的不和，忽必烈的权势如果越来越大，蒙哥就会渐渐怀疑忽必烈，反而对忽必烈不利。忽必烈听后认真分析了一下当时的形势，觉得姚枢所言非常重要，于是忽必烈就上奏兄长蒙哥大汗，请奏将军民统领权改为只掌管军事，并且得到了蒙哥大汗的批准。正是由于忽必烈的这一请奏，他跟蒙哥大汗的矛盾才没有过早的发生，这也给忽必烈的势力壮大创造了一个十分不错的机会。在总领漠南期间，忽必烈已经是一个成熟干练的人才了，他身边的谋臣侍从也都有过人之处，可以说这时候的忽必烈处在一个稳健发展的阶段。在一些事情上，忽必烈也是经常会听取部下的意见，不一意孤行，忽必烈每次做决策的时候都是很理智的。就拿选择驻地来说，忽必烈先是选择把畏兀儿当作自己的驻地，很大一部分原因是因为这个地方是突厥后裔居住的地方，不管是在风俗还是平时的生活习惯上跟蒙古人都是十分相似的。后来有幕僚向忽必烈建议将驻地选择在幽燕一带，因为这样能够更加接近中原跟江淮一些地方，更利于蒙古族的长远发展，忽必烈在深思熟虑之后，就将驻地选择在了幽燕一带。
驻地的搬迁是千万不能够忽视的，正是因为驻地搬到了幽燕一带，才得以让忽必烈成为了元朝的帝皇。忽必烈掌握军事之后，对于漠南的一些小的问题也是很关心的，也经常会跟谋臣们进行讨论。
总领漠南的忽必烈十分受人尊敬，在陕甘一带留下了很好的名声，他对百姓的关心爱护、他处理事情秉公不徇私的精神一直为当时的人们所称颂。
