由不同质荷比（m/z)的离子组成的离子束。
1.电子轰击离子源原理：试样分子或原子气化后受到灯丝发射的电子束的轰击，若轰击电子能量大于分子的电离能，分子将失去电子而发生电离，通常失去一个电子，如果再提高电子能量，将引起分子中某些化学键断裂，产生各种碎片，如阳离子，离子-分子复合物，阴离子和中性碎片。在推斥极作用下阳离子进入加速区，被加速和聚集成离子束，并引入质量分析器，而阴离子和中性碎片被真空抽走。
2.化学电离源的原理：离子室内的反应气甲烷等受电子轰击产生离子，再与试样分子碰撞产生准分子离子。
3.电喷雾电离源的原理：待测物在气化前实现离子化，易形成[M+H]+正离子和[M-H]-负离子；软电离方式，易形成多电荷离子[M+nH]n+，特别适合于高相对分子质量分子的分析(蛋白质、肽、糖等)。
4.大气压化学电离源的原理：（主要产生单电荷离子，分析的化合物相对分子质量一般小于1000。软电离方式，碎片离子很少，主要是准分子离子。）
针状电极高压放电，使空气或溶剂中某些中性分子电离，产生H3O+，N2+，O2+ 和O+等，离子与试样分子发生离子-分子反应，使试样分子离子化。主要应用于液相色谱-质谱
5.快原子轰击电离源的原理：高速电子轰击惰性气体，使其电离并且加速，进而产生快速离子，造成电荷和能量转移，然后产生快原子。快原子轰击置于涂有非挥发性底物靶上的试样分子使其电离。
6.基质辅助激光解析电离原理：待测物质的溶液与基质的溶液混合后蒸发，使分析物与基质成为晶体或半晶体，用一定波长的脉冲式激光进行照射，基质分子能有效的吸收激光能量，使基质分子和样品分子，进入气相并得到电离。
7.场电离源（FI）与场解吸源（FD）原理：强电场将从分子中拉出一个电子离子化
质量分析器的作用：是将离子源产生的离子按m/z顺序分离，相当于光谱仪器上的单色器。
质量分析器的
