次发生了流血事件，有几次甚至是全国规模的冲突。双方由于成了世代的血海深仇，都明白了要争取当时统治者的重要性。最后一次苯教和藏传佛教的大规模冲突，就是西藏历史上著名的朗达玛灭佛运动。
从朗达玛灭佛之后的一百年间，苯教短暂的重新占据了宗教主导地位，但是很快就衰败了，这一百年间被藏传佛教成为末法期。藏传佛教历史中记载的前弘期和后弘期就是以朗达玛灭佛断开的。从朗达玛灭佛之后，藏传佛教正式成为了藏地的主导宗教，地位再也没有被苯教挑战。
达玛之所以灭佛除了赤祖德赞以“七户养僧”的新制使僧人数量增多，民间苦于重税而影响生计，怨恨不平而对佛法起反感之外，他所创导的佛法乃印度晚期之佛学即大乘之精粹，绝非一般民众所能接受也是个因素。何况在翻译经典之际，禁止密乘典籍的翻译，也与吐蕃本土的宗教信仰苯教——格格不入。朗达玛是一位虔诚的苯教信奉者，
朗达玛赞普被刺杀后，吐蕃王室内分离成两派，各自支持两位年幼王子来继承赞普位。于是发生内战，且一发不可收拾，随之爆发平民起义，吐蕃王朝很快被推翻。结果不但没能重新建立新的王朝，而且以前统一的吐蕃王朝分裂成若干个小邦，从此吐蕃地区进入地方封建势力割据的时代。此间，藏传佛教虽然进入所谓的百年黑暗时期，但是并没有因朗达玛的禁废而寿终正寝，反而因为吐蕃王室的覆灭及社会上的大动荡获得了日后发展的良好外部条件，随之出现了藏传佛教史上的“后弘期”。
从九世纪中叶朗达玛灭佛开始，吐蕃佛教由极盛走向衰落。寺院被封闭或拆毁了，寺院设施被破坏了，经典的翻译及学经活动停止了，佛经多遭焚毁，僧团解体。朗达玛灭佛时，佛教僧人或被杀、或遭流放、弃佛归本、或还俗，或充当猎人和屠夫、或逃避邻国他乡。公元八四二年朗达玛遇刺身亡后，他的亲信因王被喇嘛刺杀，更加迁怒于僧，极尽捕杀之能事。卫藏等地僧人除少数逃亡者外，无一幸存。总之，朗达玛的毁佛使佛教在吐蕃的发展受到严重破坏，再想在吐蕃本部存在下去己
